《神田川JET GIRLS》讲述操控摩托艇的Jetter和用水枪攻击对手的Shooter二人一组乘搭摩托艇，在水面飞驰的运动Jet Race成为世界的主流运动。有着一位传说中的Jetter的母亲，自己也梦想成为Jet Race选手的波黄凛，离开了故乡的岛屿，来到了东京浅草。在那里她遇到了冷酷的美少女苍井美沙，两人成为了搭档。她们与对手们展开激烈比赛的同时，也在一点点地加深彼此间的牵绊。