《暗杀教室》讲述史上最凶恶的教师杀老师将月球炸掉了七成，并扬言明年要炸掉地球。 炸掉月球、又公开宣布即将於明年炸掉地球的神秘超破坏生物，突然表示要来日本的私立学校‧椚丘中学担任放牛班3年E班的导师！为了化解地球的危机，日本政府决定训练这个班级的学生来完成「杀死老师」这个重大的使命，同时祭出一百亿圆的高额奖金提升大家的动机！一场老师=暗杀目标、学生=暗杀者的超现实日常喜剧即将开始！