《蝙蝠侠大战超人：正义黎明》讲述该片故事背景设定在《超人：钢铁之躯》结尾大战后，围绕着蝙蝠侠和超人之间激增的矛盾而展开。故事发生在大都会之战18个月后，在那场战斗中许多建筑和市民惨遭波及。因为超人（亨利卡维尔 饰）帮助人类解决了很多问题而被当做神来膜拜，但超人也因与佐德之战对城市造成的破坏而遭到逮捕和审讯，一度成为都市传说的蝙蝠侠韦恩（本阿弗莱克 饰）重新出现在人们面前，他似乎正是为了惩罚超人而来。年轻的富豪莱克斯卢瑟（杰西艾森伯格 饰）又在二者的矛盾中挑拨离间，神秘的戴安娜普林斯（盖尔加朵 饰）也因自己的目的介入其中...