《Free男子游泳部第三季》讲述根据おおじこうじ原作轻小说《High☆Speed!》改编。高中毕业，心中留存着通过游泳联系起来的羁绊，向着各自的未来迈出步伐的遥等人。遥在东京和曾经一起游过接力赛的旭重逢了。遥中学时的记忆被唤醒。在他的心中苏醒的，是那时郁弥的身姿。和遥一起上京的真琴，开始向新的梦想迈进，而出发前往悉尼的凛，则在新天地迎来了意外的邂逅。在他们各自的未来前方等待着的，会是新的挑战吗？还是说，是与残存的过去之间的对峙...？